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五稜郭駅～木古内駅
| 駅名 | 現存 | 廃止年月日 |
|---|---|---|
| 五稜郭 | 現存 | |
| 七重浜 | 現存 | |
| 東久根別 | 現存 | |
| 久根別 | 現存 | |
| 清川口 | 現存 | |
| 上磯 | 現存 | |
| 茂辺地 | 現存 | |
| 渡島当別 | 現存 | |
| 釜谷 | 現存 | |
| 泉沢 | 現存 | |
| 札苅 | 現存 | |
| 木古内 | 現存 |
木古内駅～江差駅（旧江差線）
| 駅名 | 現存 | 廃止年月日 |
|---|---|---|
| 渡島鶴岡 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 吉堀 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 神明 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 湯ノ岱 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 宮越 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 桂岡 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 中須田 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 上ノ国 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |
| 江差 | 廃止 | 2014年（平成26年）5月12日 |